Мусорная часть ДНК – ценное эволюционное приобретение

Как продолжение своих предыдущих работ, в этом реферате я опишу, что собой представляет мусорная, в научной среде её ещё называют «избыточная», некодирующая, часть ДНК. Всё содержание этого реферата является моим субъективным пониманием того, что я прочитала касательно данной темы в работах по генетике, молекулярной биологии и ииссиидиологии, являющейся новой космологической концепцией строения мироздания и человека.

  

1. Введение

Как продолжение предыдущей работы, в этом своем реферате я опишу, что собой представляет мусорная, в научной среде её ещё называют «избыточная», некодирующая, часть ДНК. Всё содержание этого реферата является моим субъективным пониманием того, что я прочитала касательно данной темы в работах по генетике, молекулярной биологии и ииссиидиологии, являющейся новой космологической концепцией строения мироздания и человека.

За всю историю развития генетики, молекулярной биологии учёными были проведены разные исследования и эксперименты, которые привели к многочисленным открытиям: удалось определить химический состав, структуру ДНК, механизмы синтеза ферментов, белков, понять, каким образом передаётся генетическая информация по наследству, найти причины различных модификаций, происходящих как в самом строении, так и в функциях тех или иных участков генетического аппарата, а также расшифровать полный геном человека.

Но среди всех этих находок самым грандиозным открытием являлся проект «Геном человека», целью которого было секвенирование последовательностей нуклеотидов в молекуле ДНК человека. К середине 2000 года не имеющий аналогов по масштабам проект был успешно реализован. В процессе работы исследователи определили то, что кодирующие белок нуклеотиды (экзоны) составляют около 2% генома, а остальные 97% – это масса ничего не обозначающих объектов, не способных кодировать ни белок, ни РНК. Данный участок ДНК учёные назвали «мусорная», избыточная, эгоистичная часть генетического аппарата, т.к. её главная функция им была непонятна и неясна. Появился даже специальный термин «selfish DNA», что переводится как «эгоистичная ДНК» [1].

Зачем нужны клетке эти «бессмысленные» и никак, на первый взгляд, не работающие элементы ДНК, хотя априори ясно, что ничего лишнего в природе не должно быть?

Кроме этого вопроса, результаты данной грандиозной работы породили ряд других непониманий, что привело к созданию еще одного масштабного проекта.

Таким образом, вскоре после завершения секвенирования генома человека, в сентябре 2003 года, запустили международный исследовательский консорциум под названием «Энциклопедия элементов ДНК» (англ. The Encyclopedia of DNA Elements, ENCODE) Целью этого проекта было — произвести полный анализ функций элементов генома человека, а первостепенной задачей – определить функцию той части генома, которая традиционно рассматривается как «мусор» [2]

К концу 2012 года появились первые результаты проекта ENCODE. Деятелями науки было определено, что около 80 % генома человека является биологически активным, туда и входит большая часть «мусорной» ДНК [3]. Кроме того исследователи заявили, что большая часть «мусорной» ДНК выполняет регуляторную функцию.

Однако такие поспешные выводы подвергались критике со стороны многих учёных, которые указывали на отсутствие необходимых доказательств функциональности этих элементов. Но при всём при этом сегодня многие учёные вынуждены отказываться от своих первоначальных, довольно ограниченных представлений, т.к. результаты многих экспериментов показали, что так называемые «эгоистичные» или «бессмысленные» участки генома, на самом деле выполняют эволюционно значимую функцию и роль.

2. Мусорная часть ДНК – ценное эволюционное приобретение

2.1. Мусорной ДНК больше всего в геноме человека

При сравнении данных с геномами животных, стоящих на различных ступенях эволюционной лестницы, выяснилось, что чем сложнее устроен организм, тем меньше в его геноме доля кодирующих участков и тем больше в нем доля непонятной для нас информации. И больше всего её в геноме человека, при любом расчёте более 70% всей ДНК! Такого количества геномного «мусора» нет ни у бактерий, ни у дрожжей, ни у мух [4]. На первый взгляд это выглядело парадоксально. Как это ни странно на первый взгляд, но факт остается фактом.

Что это значит? Или наш геном в отличие от геномов более примитивных организмов ленится выгребать накапливающийся «мусор», или это совсем не мусор, а некое ценное эволюционное приобретение, которое дало когда-то человеку определенные преимущества, и поэтому геном от такого «мусора» не спешит избавиться [4]. В науке есть разные предположения на этот счёт. Например, что эти нуклеотидные последовательности ДНК являются резервуаром эволюции, складом «запчастей». Если с каким-либо геном что-то не в порядке, клетка использует фрагменты некодирующей ДНК для «ремонта» поврежденного [4].

Но главная суть всех вариантов размышлении заключается в том, что эти объекты обладают определёнными функциями, которые необходимо выяснять.

2.2. Имеется ли в геноме «эгоистичная» ДНК?

В 2012 году группа учёных из американского исследовательского центра Томаса Уотсона заявила, что 80% генома, который считался бесполезным, на самом деле активен, а значит, исполняет какие-то функции, но какие? [5]

Владимир Гвоздев, заведующий отделом молекулярной генетики клетки, в одном из своих выступлений говорит: «Оказалось это всё очень нужно, в том числе для иммунной защиты от внедрения чего-то чужеродного в клетку, что может быть губительно для клетки и для организма». С каждым годом в этой области науки совершаются десятки уникальных открытий [5].

Сегодня учёные вынуждены признать, что изученный геном человека – это всего лишь верхняя часть айсберга, т.е. базовая схема развития организма. Главная программа, отвечающая на вопрос, кто мы и откуда, ещё не расшифрована.

Сторонники волновой генетики говорят, что наши гены – это своеобразные антенны в космос и главная их задача – получать из вселенной информацию.

2.3. Структура мусорной ДНК

В результате многочисленных исследований по расшифровке полной структуры генома человека было выяснено, что всего 2% ДНК кодируют белок, а остальные 98% всего генома не участвуют напрямую в данном процессе, и не понятно было, для чего они нужны организму. Такой вопрос на сегодняшний день всё ещё остаётся актуальным.

Структурными объектами 98% ДНК являются: интроны, которые занимают 26% межгенного пространства, т.е. это те части, которые являются некодирующими (в процессе формирования зрелой и-РНК они урезаются комплексом белков и РНК), гетерохроматин (18%), повторы (8%), которые подразделяются на тандемные (сателлитная ДНК, минисателлиты, микросателлиты) и диспергированные (длинные SINE-ы и короткие LINE-ы), транспазоны, ДНК-транспазоны, ретровирусы (ретротранспазоны), теломерная ДНК (0,03%).

Данная классификация не является окончательной, т.к. большая часть объектов на текущий момент не классифицирована мировой научной общественностью.

2.4. Каковы же функции у ДНК, считавшейся много лет «эгоистичной»?

Как было выше сказано, через многочисленные исследования генетики пытаются понять функции и задачи составных элементов некодирующей ДНК. Некоторые пытаются найти ответ на вопрос: для чего три миллиарда пар нуклеотидов человеческой ДНК? Другие предполагают, что некодирующая ДНК — нечто вроде промежутков, удерживающих гены на определенном расстоянии друг от друга.

Итак, давайте рассмотрим основные из предположений, находок учёных, чтобы дальнейшее повествование было более понятным и ясным.

2.4.1. Повторные элементы занимают основную часть генома человека

Одной из основных частей в геноме человека, занимающей около 50% всего текста ДНК, являются повторные элементы, которые не кодируют никакие белки, но при этом многократно встречаются. Они напоминают бессмысленные фразы, повторяющиеся в разных вариантах в тексте, но от этого смысл в них всё равно не возникает [4].

 
Рис. 25. Основные варианты расположения повторяющихся последовательностей в геноме человека. Повторы обозначены стрелками, неповторяющиеся участки — серыми линиями.

а) Сателлитные ДНК (простые тандемные повторы)

Одними из них являются простые тандемные повторы, их ещё называют сателлитными ДНК. Это короткие повторяющиеся нуклеотидные последовательности, которые расположены вплотную друг за другом (тандемно). Если записать их структуру текстом, то это выглядит, как, например, предложение из одного и того же слова: столстолстолстолстолстолстолстолстол. Учёные говорят, что такие предложения не могут кодировать никакую серьезную информацию [4].

К настоящему времени в геноме человека обнаружено по крайней мере шесть видов сателлитных повторов, три из них называются классическими, а остальные три это альфа-, бета-, гамма-сателлитные повторы.

Распределение всех сателлитных ДНК вдоль хромосом не выглядит случайным. Так, некоторые из них локализуются в районах, прилежащих к концам хромосом, и в области центромеры (перетяжка на хромосомах, которая не всегда расположена в самом центре, см. рис. 7). В частности, центромеры всех хромосом человека, размер которых варьирует от 0,1 до 4 млн. п.н., состоят преимущественно из альфа-сателлитных ДНК [4].

Наряду с типичными сателлитными ДНК, в геноме человека имеются нуклеотидные последовательности, получившие название мини- и микросателлитов, которые разбросаны по большинству участков всех хромосом и в сумме составляют около 3% генома человека. Минисателлиты представляют собой повторяющиеся нуклеотидные последовательности размером от 11 до 500 п. н., а микросателлиты еще меньше по размерам (10 и меньше п. н). Когда же в тексте повторяется всего одна «буква» из четырех, такие структуры называют гомополимерными нуклеотидными последовательностями. Примером гомополимерной последовательности нуклеотидов в геноме человека может служить последовательность ААААААААААААААААААААААА на одной нити и, соответственно, ТТТТТТТТТТТТТТТТТТТТТТТ на другой [4].

Выше приведенный пример и множество других случаев указывают на то, что микро- и минисателлиты весьма изменчивы (полиморфны). Их распределение и число в геноме каждого конкретного человека столь специфично, что может использоваться в качестве аналога отпечатков пальцев. На основании вариабельности сателлитных ДНК была развита диагностика родственных связей между людьми, склонности человека к различным заболеваниям и др [4].

И, наконец, еще один вид сателлитной ДНК был обнаружен при секвенировании генома человека, который получил название мегасателлитов. Эти тандемные повторы имеют размер от 2,5 до 5 тыс. п. н. и повторяются от 50 до 400 раз.

б) Перевёртыши (обращенные повторы)

В ДНК клеток человека и других организмов, присутствуют уже упоминавшийся обращенные повторы, перевертыши или, как их еще часто называют, палиндромы. Перевертыши-палиндромы хорошо известны из литературы — это предложения, которые читаются одинаково слева направо и справа налево без учета знаков препинания [4].

в) Концы молекул ДНК – теломеры – объект повышенного внимания

Устройство концов хромосом давно интересовало исследователей. Теперь стало ясно, что они устроены по особому. И эту некодирующую белки ДНК никак нельзя назвать «эгоистичной». Концевой участок ДНК, называемый теломерным, представляет собой область размером 3–20 тыс. п. н., состоящую из тандемно расположенных повторов TTAГГГ. С этими участками образуют комплекс различные специфические белки, и такой комплекс получил название теломера [4].

Самый-самый (в данном случае левый) кончик хромосомы человека выглядит так:

ГГГАТТГГГАТТГГГАТТГГГАТТГГГАТТГГГАТТ…

ЦЦЦТААЦЦЦТААЦЦЦТААЦЦЦТААЦЦЦТАА…

То есть каждый том Энциклопедии человека начинается с буквы Г, и первые 6 букв — это однонитевая ДНК, а вовсе не двунитевая. 3а короткими повторами располагаются более длинные повторяющиеся последовательности, которые назвали повторами, ассоциированными с теломерой. Далее следуют уникальные для каждой хромосомы последовательности. Теломеры защищают основную часть ДНК от действия ферментов, которые в отсутствие теломер разрушали бы молекулы ДНК. Кроме того, теломеры способствуют правильной рекомбинации хромосом и их прикреплению к оболочке ядра[4].

Концевые участки хромосом не статичны. При каждом делении клеток происходит их укорочение в среднем на 50 п. н. Все известные ДНК-полимеразы, которые участвуют в процессе репликации ДНК, неспособны полностью реплицировать концы молекул. Поэтому каждая следующая копия короче предыдущей. Как если бы машинистка, перепечатывая книгу, всегда ленилась бы перепечатать последнюю страничку [4].

Чтобы не происходила потеря генетического материала при делении клеток, у эмбрионов концы молекул ДНК наращиваются перед каждой репликацией короткими повторяющимися последовательностями. В этом участвует специальный фермент — теломераза. Однако в клетках взрослого организма этот фермент перестает работать, и в результате хромосомы постоянно укорачиваются, съеживаются, как шагреневая кожа, при каждом цикле репликации ДНК. Так происходит до определенного предела, после чего деление клеток становится, по-видимому, невозможным и наступает их гибель [4].

Науке таже известно, что повторами в геноме человека являются в том числе представленные сотнями копий гистоновые гены, имеются тысячи копий генов, кодирующих рибосомные РНК, транспортные РНК и др. В дальнейшем выяснилось, что существуют и повторы, расположенные в концевых некодирующих белки участках мРНК, которые принимают, по-видимому, участие в таком важном процессе, как трансляция этих молекул. Повторы, расположенные в участках, кодирующих мРНК, несут определенную функциональную нагрузку. Они нередко участвуют в правильном и своевременном считывании информации при образовании белка на м-РНК. Однако в сумме доля таких значимых повторяющихся участков генома человека весьма невелика [4].

д) Диспергированные повторы (длинные, короткие, длинные концевые повторы – ретротранспазоны, ДНК-транспазоны) это и есть транспазоны.

В геноме человека также содержится множество более длинных повторяющихся нуклеотидных последовательностей, которые в отличие от сателлитных повторов рассеяны (диспергированы) по всему геному. Эти повторы называют вездесущими, так как они присутствуют во всех районах всех хромосом, а иногда обнаруживаются даже и внутри генов. В сумме около половины ДНК-ового текста генома человека представлено такими повторами [4].

Исследователи разделяют эти разбросанные по геному (диспергированные) повторы на 4 основных типа. Наиболее представленными в геноме являются длинные диспергированные повторы (сокращенно ДДП, основной представитель длинных диспергированных повторов генома человека — семейство повторов, получившее имя LINE). Их длина достигает 6 тыс. п. н.(в сумме ДДП составляют около 21% генома). В ходе множество исследовании было определено то, что длинные повторяющиеся последовательности могут участвовать в процессе «тасования экзонов» (подробно тасованию карт), т. е. перемещения экзонов из одних генов в другие и формирования за счет этого новых генов [4].

Далее — это короткие диспергированные повторы (сокращенно КДП) длиной 100–400 п. н. В ДНК человека они составляет около 13% генома. Основную массу коротких диспергированных повторов (КДП) составляют так называемые Alu-повторы, которые занимают в ДНК человека почти в 10 раз больше места, чем все последовательности, кодирующие белки. Исследователи считают, что способность Alu-повторов к перемещению может играть существенную роль в эволюции генома. Например, описаны случаи, когда, внедряясь в экзон или интрон какого-нибудь гена, такой повтор менял регуляцию его экспрессии. Alu-повтор способен также модулировать процесс репликации ДНК, регулировать сплайсинг и некоторые другие генетические процессы [4].

Одним из источников мусорной ДНК в нашем геноме являются еще повторяющиеся элементы, окруженные с двух сторон дополнительными повторами (последние называют длинными концевыми повторами). Их назвали ретротранспозонами. Они занимают 8% всего генома [4].

И наконец, в геноме человека присутствуют повторы, названные ДНК-транспозонами. Длины разных ДНК-транспозонов существенно отличаются (от 80 до 3000 п. н.). В геноме их меньше, чем других повторов – всего 3%.

Для всех этих 4-х типов повторов характерно отличительная и важная особенность – это способность перемещаться в геноме, т.е. умеют «прыгать».

В соответствии с законами классической генетики ожидалось, что в геноме все должно быть четко размечено, все гены-предложения должны располагаться в строго определенных местах текста. И большинство элементов генома действительно подчиняется этому общему правилу. Но из общего правила всегда есть исключения. Оказалось, что некоторые участки ДНК могут «путешествовать», меняя свое место, вытесняя друг друга. Подавляющее большинство генов никогда не покидают родную хромосому. Но в отличие от них определенные специфические нуклеотидные последовательности ДНК обладают способностью «выпрыгивать» из одной хромосомы и приземляются в случайном месте на другой. При этом они могут влезть в середину гена, вызывая хаос, а могут примкнуть с края, слегка видоизменяя его регуляцию [4].

е) Транспазоны

Основное перемещение в геноме человека осуществляют не гены, а элементы совершенно другого типа, получившие название транспозонов. К ним относят различные элементы, входящие во все четыре выше перечисленных основных типа диспергированных повторов генома. Транспозоны способны к разным инновациям в геноме. Перемещаясь, они могут изменять регуляцию других генов и даже принимать участие в создании новых генов. Так, после полного секвенирования генома человека в нем удалось обнаружить около пятидесяти генов, произошедших из транспозонов. Несколько сотен генов в геноме человека используют длинные концевые повторы транспозонов в качестве терминаторов при транскрипции [4].

Считается что такие мобильные генетические  элементы как транспазоны имеют вирусное происхождение.Эти последовательности обезвреживаются в клетке, у них исчезает способность автономно прыгать из одного участка ДНК в другой, однако из самой ДНК они никуда не исчезают. Можно сказать, они представляют собой что-то вроде компьютерного вируса, помещённого в карантин [4].

Среди транспозонов, которые также были прежде отнесены к «эгоистичной» ДНК, исследователи постепенно обнаруживают  различные неизвестные ранее регуляторные последовательности, которые управляют работой ряда генов. Некоторые из транспозонов выступают в роли энхансеров (усилители транскрипции), сайленсеров (ослабители транскрипции), терминаторов транскрипции и прочих красиво звучащих элементов генома. Более того, выяснилось, что не менее полусотни генов генома человека имеют свое происхождение из транспозонов. Наконец, следует отметить, что определенные некодирующие белки участки ДНК обеспечивают процесс ее репликации, другие — упаковку в хромосомы, третьи — прикрепление к определенным структурам в ядре и т. д [4].

Можно думать, что в результате этого подвижные или мобильные элементы способны в ходе эволюции заметно «тасовать» текст Энциклопедии человека подобно тому, как игроки тасуют колоду карт [4].

2.4.2 Вирусы структурируют геном человека

Некоторые из диспергированных подвижных повторов имеют вирусное или бактерияльное происхождение, и таковым относятся ретротранспазоны и ДНК-транспазоны. Сходство подвижных повторяющихся элементов  с инфекционными вирусами было обнаружено в процессе секвенирования ДНК человека.

Ряд вирусов проникая внутрь клетки обладают способностью становиться частью генома хозяина. Такими возможностями обладают ретровирусы. Они так были названы по своему образу жизни. Исходно геном этих вирусов представляет собой РНК. Но, попав в клетку, вирус на своей РНК с помощью обратной транскриптазы строит ДНК-копию. После этого ДНК-копия вируса встраивается в геном клетки, что служит обязательным условием для жизненного цикла ретровируса. Встраиваемая в геном клеток человека ДНК-копия вируса была названа провирусом. Затем на провирусе синтезируются вирусные РНК, на базе которых образуются новые вирусные частицы. Таков жизненный цикл обычного ретровируса. Так ведет себя, например, хорошо известный ретровирус, получивший название вируса иммунодефицита человека (ВИЧ), когда он инфицирует клетки крови [4].

При инфицировании соматических клеток гены вирусов не могут передоваться по наследству, т.к. они не участвуют при зачатии эмбриона. Так называемая проблема возникает тогда, когда происходит инфицирование вирусами клеток зародышевого пути, потому что внедренный провирус становится наследуемым элементом генома человека.

Так в клетке появляется «лжепрограмма» (провирус), которая изменяет геном гораздо сильнее, чем это возможно при «нормальной» эволюционной изменчивости [4]. Давайте попробуем разобраться, что собой представляют ретротранспазоны, которые как раз и являются  остатками определённых типов ретровирусов.

Ретротранспазоны – это повторяющиеся элементы, способные кодировать 2–3 белка и окруженные с двух сторон длинными концевыми повторами (ДКП). Они считаются остатками древних вирусных инфекций, частицы генов которых беспорядочно проникали в ДНК других видов, в том числе и в ДНК человека. У человека они составляют довольно существенную часть — около 8% генома. Такие элементы называют часто эндогенными ретровирусами, в отличие от типичных ретровирусов, существующих в природе вне организмов (их называют экзогенными ретровирусами). Она напоминает структуру отдельных современных экзогенных ретровирусов, хотя часто существенно отличается от них. Все-таки за миллионы лет древним провирусам трудно было остаться неизменными. Большая часть этих элементов представляет собой дефектные вирусные последовательности или даже отдельные их короткие фрагменты. Происходило это главным образом за счет накопления точечных мутаций. В частности, у многих эндогенных ретровирусов отсутствует ген env [4].

Мутации, накопившиеся в ходе эволюции в эндогенных ретровирусах, не позволяют им образовывать новые инфекционные вирусные частицы, как это происходит обычно в случае типичных экзогенных вирусов (например, вируса иммундефицита человека).

Наука считает, что такие провирусы появились в геноме человека от 10 до 50 млн. лет назад в результате инфицирования зародышевых клеток наших предшественников и с тех пор передаются по наследству, как и все другие собственные элементы генома. Так «чужие» молекулы ДНК стали частью нашего генома. В сумме их насчитывается несколько десятков тысяч. Ретротранспозоны генома человека часто рассматривают как «ископаемые останки» древних ретровирусов [4].

Итак, эндогенные провирусы являются «следами» от вирусов, которые инфицировали людей миллионы лет назад. Поселившиеся в геноме наших предков, они со временем потеряли способность образовывать новые вирусные частицы. Большинство таких «реликтовых» ретровирусов «молчит» (не функционирует). Однако сейчас уже установлено, что при определенных воздействиях на геном они могут «заговорить» и этим нарушить нормальный метаболизм в клетке. Таким образом, потенциально некоторые из них и по прошествии тысячелетий продолжают представлять потенциальную опасность для человека [4].

В геноме человека эндогенные ретровирусы встречаются во многих местах, но их распределение по хромосомам не совсем равномерное. Часто они располагаются в регуляторных областях генов. И в этом ученые видят особый смысл: регуляторные элементы эндогенных ретровирусов могут вмешиваться в регуляцию работы обычных генов человека.

Деятели науки предпологают, что появление провирусов повлияло на ход становления человека как вида.

И последний пример функциональной значимости «эгоистичной» ДНК – это гены бактерий. В результате секвенирования ДНК человека был раскрыт еще один секрет генома. Кроме вирусов, проникших в наш геном извне и со временем сильно размножившихся там, заметную часть генома человека составляют ещё и гены бактерий, получивших название ДНК-транспозонов. Они в сумме составляют около 3% генома человека и представлены в нем примерно 300 000 копиями. Все они по своей структуре очень напоминают ранее обнаруженные перемещающиеся элементы у бактерий — бактериальные транспозоны. Сходство выражается в первую очередь тем, что ДНК-транспозоны человека, как и бактериальные транспозоны, способны кодировать специальный фермент транспозазу, который и обеспечивает их подвижность[4].

Кроме бактериальных транспозонов, в геноме человека содержится свыше 220 генов, доставшихся нам «в наследство» непосредственно от бактерий, обитающих у нас в кишечнике. Теперь стало окончательно ясно, что бактерии, также как и вирусы, внесли свой вклад в формирование генома современного человека. Все это, по-видимому, есть результат длительного сожительства человека с бактериями, когда при некоторых случайных событиях гены бактерий попали в геном человека и там закрепились. Мы давно знаем, что в нашем кишечнике живет много разных видов бактерий, которые не только для нас не вредны, но, наоборот, полезны, так как они служат поставщиками ряда биологически активных продуктов (в частности, некоторых витаминов).

Перенос генов «по горизонтали», т. е. от одного вида организма в другой, в принципе был известен давно. Но то, что он столь масштабно выражен и между геномами таких эволюционно далеких организмов, как человек и бактерии, безусловно, стало для исследователей полной неожиданностью. Интересно, что гены, доставшиеся человеку от бактерий, содержат, как и многие другие, интроны. Последних нет у бактерий [4].

А значит, в процессе эволюции после переноса бактериальных генов в геном человека произошло еще одно событие: в состав «бактериальных» генов, ставших генами человека, внедрились дополнительные нуклеотидные последовательности, которые теперь являются интронами [4]. Гены, доставшиеся человеку от бактерий, играют важную роль в метаболизме ксенобиотиков (чужеродных для человеческого организма веществ) и в ответе клеток на стресс [4].

Как итог следует отметить, что все выше перечисленные описания говорят о том, что бактерии, также как и вирусы, внесли большой эволюционный вклад в формирование генома современного человека.

Таким образом, согласно современным оценкам, в участках «эгоистичной» ДНК скрыта определенная эволюционная информация. В результате активности, на самом деле работоспособности этой, пока что в большей степени, я бы назвала, «тайнственной» (не мусорной) части генома могут происходить разного типа модификаций не только в самой структуре, но в функциональных возможностях всего генетического аппарата.

3. Что говорит ииссиидиология о «мусорной» части ДНК?

Ииссиидиология говорит, что элементам межгенного пространства («мусорной» части ДНК) свойственна регуляторная функция, т.е. они обеспечивают исполнение функции Творцов-регуляторов [6]. Из всей совокупности объектов некодирующей части, автор на данном этапе написания томов ииссиидиологии, большей степени описывает то, что собой представляют эндогенны ретровирусы и транспазоны. Эти межгенные структуры способностями регулировать работой тех или иных генов ядерной ДНК обладают потому, что являются высокоорганизованными, высокоразвитыми формами самосознаний. Хотя с позиции наших нынешних – весьма ограниченных! - представлений о высоком уровне развития, многим людям подобное утверждение может показаться смешным и нелепым. Но, тем не менее, это так и есть: вирусы – это по-своему высокоразвитые (для условий эксгиберации в данном диапазоне мерности!) формы самосознаний [6]. Просто, они развиваются свойственным им типе бирвуляртности  и поэтому нам не с чем сравнить амплификационную (эволюционную) суть свойственных им функций и реализаций.

Состав генов эндогенных «ретровирусов», свойственных человеческому ДНК на протяжении многомиллионов лет, на разных этапах биологического сушествования заметно изменяется (в результате постепенной деградации) и обновляется (в результате внутренних мутаций), в зависимости от особенностей тех амплификационных задач и возможностей, которые определяют реализационную суть коллективного сознания человечества [6].

Отклоняясь от основной темы, хочу напомнить, что Творцы-регуляторы[1]  – это те «структуры», которые являются носителями программ развития как людей, так и других Прото-Форм (животных, растений, минералов, атомов, молекул, элементарных частиц и т.д.). Формами их реализаций в структуре ДНК являются регуляторные гены, последовательности, белки, а также, как я написала в предыдущем абзаце, элементы межгенного, или на языке ииссиидиологии, диверсивного пространства.

Итак, давайте рассмотрим, в чём заключается организованность, развитость вирусов (структуририующих геном человека), какими свойствами они обладают, «чем живут», как взаимодействуют объектами окружающей действительности.

Формы самосознаний вирусов, проникших через половые клетки – каждый в своё время и своими путями! - в структуру человеческих геномов за сотни тысяч и миллионы лет, в большей степени коварллертны (схожы, способны многосторонне взаимодействовать) с фокусными динамиками каких-то из животных или растительных Прото-Форм, поскольку, отлично овладели искусством встраиваться в ДНК практически всех биологических существ и приспособились совершенно незаметно, как и бактерии, существовать в их организмах, так или иначе, влияя на синтез (образование, формирование) СФУУРММ-Форм (представлений) всех этих существ, через процесс активизации соответствующих генов [6].

Именно это сходство вирусов с разнопротоформными свойствами используется Творцами-регуляторами человеческого генома в качестве одного из резонационных источников информации, для привлечения в фокусную динамику человека психоментальных признаков других Прото-Форм. Главная Суть регуляторных функций, выполняемых ими в нашей ДНК, сводится к резонационному подключению Формо-Творцов «личностного» Самосознания к определённым ферам творчества ОДС с целью биохимического Синтеза био-Творцами нашего организма соответствующих психоментальных состояний с параллельным заполнением этими СФУУРММ-Формами нашей Фокусной Динамики. На базе осуществляемых при этом психических реакций и выборов в «субтеррансивной ОДС» - через синаптический механизм формирования долгосрочной памяти – каждым из нас синтезируется соответствующий эмпирический опыт существования. Важно отметить, что ретровирусы способны реконструировать наш геном при помощи генетических модификации, которые приводят, с амплификационной точки зрения, полезным результатам. 

Как же происходит воздействие этих (межгенных, «мусорных») регуляторных элементов на фокусную динамику (психоментальную деятельность) личности? Прежде всего, через гены и выполняемые ими функции по организации биохимических процессов в человеческом организме разнопротоформных био-творцов. При устойчивом погружении человека в определённые психоментальные состояния, не свойственные ллууввумическим (Человеческим), который характеризуется такими признаками как высокочувственный интеллект (ВЧИ) и высокоинтеллектуальный альтруизм (ВИА), в диверсивной части ДНК автомотический (консуетно) активизируется эндогенный ретровирус, т.е. ретротранспазон, резонационно соответствующий этому протоформному состоянию (иногда они размножаются, встраивая в разные места хромосом сотни своих копий и образуя внутри генома своеобразные «семейства»). В свою очередь, эта активность побуждает био-творцов клетки на выработку фермента обратной транскриптазы, который использует встроенную вирусную РНК в качестве матрицы для синтеза ДНК.

С помощью другого вирусного фермента — интегразы — осуществляется встраивание этой ДНК из диверсивной части, в резонационно соответствующим ей, белок кодирующий ген. Таким образом в геноме появляется новая, вирусного происхождения матрица для синтеза белков,  с учётом только тех инструкций, которые закодированы в вирусной РНК, тем самым создавая условия для формирования в фокусной динамике личности строго определённых сочетаний СФУУРММ-Форм какой-то из Прото-Форм, со временем на основании которых будет синтезироваться недостающий опыт для осуществления более амплиативных (более совершенных, качественных) вариантов выборов и творческих реализаций.

Основной функцией ретротранспазонов является обеспечивание, под руководством Творцов-регуляторов, корректировку синтетических процессов происходящих в самосознании личности в тех или иных протоформных направлениях. На разных этапах жизни личности, активизируясь в геноме и встраиваясь в резонационные им фрагменты ДНК, они решают поставленную перед ними – Творцами-регуляторами – задачу.

Синтетические процессы то в одном, то в другом протоформном  направлении, необходимы для стабилизации амицирационных процессов, происходящих в самосознании личности, в пределах ллууввумического направления развития. То есть, проходя через множество жизненных сложностей, проблем, боль, потери и тому подобные переживания,  человек приобретает мудрость, разумность, понимание, сострадание, безкорыстную любовь ко всему окружающему, такие качества как честность, искренность, открытость, ответственность становятся естественной частью его самосознания. Таким образом, человек становится Человеком с большой буквы, ему леко и быстро удаётся находит объяснение, мотиваций всему происходящему как вокруг, так и внутри себя, меняется система ценностей, что и характеризует стабилизацию фокусной динамики данной личности в ллууввумическом направлении развития.

Но, здесь очень важно знать! При продолжительной активности в геноме ретратранспазонных генов, происходит черезмерная активизация протоформных СФУУРММ-Форм, за счёт постоянного кодирования белков, являющихся выразителями этих представленний, результатом чего  является амицирирование (смещение) фокусной динамики личности от ллууввумического в любое другое протоформное направление. Обычно это происходит бессознательно и никак не зафиксируется в памяти самого индивидуума.

Ещё есть одна важная деталь, если разнопротоформные био-творцы каждой клетки, не в состоянии постичь истинный Смысл их функций, то они стараются подавить активность транспозонов, но не смотря на это задача межгенных структур остаётся продвигать развитие личности именно в амплиативном (ллууввумическом) направлении развития, и соответственно своим целям, задачам осуществлять разного типа генные модификаций направленные на изменение качественности «нынешних» функции генов, предрасположенных к протоформным реализациям.

Ведь для процесса усовершенствования биологических организмов обычным делом является не столько изобретение новых генов, сколько своевременная коррекция, регулирование деятельности Творцов-интерпретаторов уже имеющихся генов. Такие мобильные генетические элементы как транспозоны и регуляторные гены (а также разнообразных вирусные и прочие РНК) помогают всему множеству структурных генов правильно (в соответствии с требованиями Схемы Синтеза) организовывать время и место применения ими своих функций, что и приводит к  повышению степени амплиативности СФУУРММ-Форм в самосознании  «личности».

Таких мобильных транспозонов в различных локусах ДНК может быть множество и все их «путешествия» по некодирующим зонам генома носят, скорее всего, информационный, инспекционный для регуляторных форм самосознаний характер, чтобы, при обнаружении в каком-то из участков генома устойчивых протоформных тенденций, вовремя подправить или дополнить какие-то из регуляторных последовательностей с целью усиления амплиативного влияния на определённый ген, рядом с которым встроился транспозон. Подобное упреждающее «инспектирование» окружения тех генов, которые непосредственно не задействованы в процессах кодирования, может достаточно конструктивно сказываться на поддержании высокой степени активности ллууввумических признаков в их функциях, не позволяя каким-то генам слишком глубоко и надолго активизироваться в реализации тех или иных протоформных тенденций.

Но если транспозон обнаруживает в каком-то участке генома серьёзное нарушение и для выполнения своей амплификационной задачи, возложенной на него Творцами-регуляторами, принимает решение напрямую вмешаться в какую-то кодирующую последовательность, то обычно такое воздействие заканчивается всевозможными деструктивными последствиями в функционировании генома. Причём, при субъективном анализе ситуации уже в новом «сценарии» (где «личность» выздоравливает и продолжает своё Существование), всё выглядит так, будто транспозоны в данном месте генома были каким-то образом «обезврежены» био-творцами организма. В действительности же, выполнив свою задачу в данном участке, данные мобильные регуляторные элементы передислоцировались в другую часть генома.

Когда по каким-то причинам (например, в результате мощного стресса) происходит рекомбинация гена в другую часть хромосомы или генома, то он выпадает из характерного для него окружения (сферы ллууввумического контроля) и оказывается в окружении совершенно других, не свойственных ему, регуляторных форм самосознаний, которые не в состоянии корректировать все его функции в соответствии с человеческой Схемой Синтеза, потому что ориентированы на курирование других, прилежащих только к ним, генов. В таких случаях функциональная «Программа» рекомбинированного (вынужденно «передислоцированного») гена, лишившись непосредственного ллууввумического контроля, может произвольно переориентироваться на любую другую Схему Синтеза, что может внести серьёзный диссонанс в работу био-творцов всего организма и вызвать глубокие деструктивные изменения в тех системах и органах, работа которых частично обеспечивается также и функциями данного гена.

Обычно подобные трансформации бывают неизлечимыми, ведь для того чтобы нормализовать деятельность био-творцов, надо найти надёжный способ, который мог бы обеспечить возвращение «гуляющего» гена на своё законное место (и в свойственное именно ему окружение, чтобы регуляторные гены могли соответствующим образом направлять всю его деятельность). В связи с тем, что самые разнообразные деформации происходят в структуре ДНК постоянно, в каждой клетке существует специальная система репарации – ремонта и восстановления повреждённых участков генома, которая, ликвидируя непрерывно образующиеся ошибки и повышая его стабильность, препятствует возникновению у нас различных генетических заболеваний.

В действительности же, основная цель этих регуляторных форм самосознаний в ДНК клеток человека – поддерживать в фокусной динамике каждой «личности» именно амплификационные, а не ретардационные (т. е. деградационные) тенденции, способствуя последовательной перестройке разнопротоформных деятельности био-творцов системы восприятия (как коры, так и подкорки) на синтез, в большей степени, ллууввумических СФУУРММ-Форм. Следовательно, в человеческом организме все элементы «мусорной» части генома людей задействованы Творцами-регуляторами в реализации общей ллууввумической «Программы развития», с целью стабилизации фокусной динамики в пределах ллууввумического типа бирвуляртности.

В процессе написания предыдущего и этого реферата, ну и вообще в ходе описания многоуровневых функций, задач структурных элементов всего генетического аппарата, у меня возник образ большой планеты, под названием ДНК, существующий в ядре каждый клетки организма людей, животных, растений, бактерий и других форм жизни, где под руководством Творцов-регуляторов занимаются творчеством огромное множество разнопротоформных сущностей, выполняя эволюционно значимую роль не только в развитии всего биологического тела, но и в амплификаций фокусной динамики самосознания форм проявленных многочисленных вариантах сценариев развития.

4. Заключение

Как заключение следует отметить, что ДНК это незастывшая, а динамическая структура, чем-то напоминающая атом. Последний имеет не только стабильное ядро, но и целый рой перемещающихся вокруг его элементов (в частности, электронов). Именно поэтому академик Г. П. Георгиев справедливо отметил, что «ген постоянен в своем непостоянстве»! [7]

Каждый участок так называемой «избыточной» части, как и всей ДНК, выполняет свою функцию, но, в случае необходимости, может решать такие задачи, которые в сферу его деятельности как бы не входит: одни обеспечивают процесс её репликации, другие – упаковку в хромосомы, третьи – прикрепление  к определенным структурам в ядре, четвёртые – регулируют  процесс активности генов и т. д. То есть список, скорее всего, может быть достаточно длинным, как книга с огромным количеством страниц, где каждое, слово, предложение имеет многозначный смысл, при чтении которых каждый расшифровывает то, что способен воспринять и понять.

Основной итог всего выше сказанного то, что наука на сегодняшний день уже признает то, что мусорная часть генома, на самом деле не является таковым, но основательно, пока что, доказать и объяснит не может. По мнению учёного Уэйта Гиббса, "генетический мусор" во многом напоминает космическую "темную материю": подавляющее большинство ученых сходится в том, что и тот, и другая, безусловно, должны играть очень важную роль в природе, будь то ее макро- или микрокосмическая (молекулярная) ипостась. Но в чем именно заключается их роль - пока никому не ясно.

Но ииссиидиология, как новая концепция строения вселенной и человека, вносит существенное дополнение, в эту область науки представляя «мусорную» часть ДНК как многофункциональную структуру, которая регулирует жизненно необходимые внутриклеточные процессы, соответственно ллууввумическим программам Творцов-регуляторов, тем самым выполняя эволюционно важную роль в формировании органов и тканей организма человека и в развитии его самосознания приоритетном – ллууввумическом – направлении.

Полученные результаты в области генетики, молекулярной биологии дают мало окончательных ответов, но зато рождаются много идеи для размышлений об эволюционной значимости «мусорной» части ДНК.

Как говорят эволюционисты, делать далеко идущие теоретические выводы рано: исследователи только начали проникать в некую совершенно новую, весьма необычную область. Со своей стороны, в завершение написания реферата, хочу дополнить данное оптимистичное высказывание специалистов науки тем, что ответы, объяснения, которые даёт ииссиидиология расширять границы научных исследований и следовательно приведут новым открытиями

 

[1] О функциях и задачах, свойствах Творцов-регуляторов я писала, с позиции своего субъективного понимания всего прочитанного по этой теме в книгах ииссиидиологии и разных материалах по генетике, в своем предыдущем реферате, который называется «Творцы-регуляторы управляют регуляторными механизмами ДНК». Более подробную информацию можно будет узнать об этих «структурах»  в 5-м томе Основ ииссиидиологии, который на сегодняшний день, пока что,  находится процессе написания автором этого знания.

 

Термины, использованные в этом реферате:

Транспозон — подвижный генетический элемент, способный к самостоятельным перемещениям (транспозиции) и интеграции в разные участки хромосомной или внехромосомной ДНК.

Гетерохроматин – область хромосомы (иногда целая хромосома), имеющая плотную компактную структуру.

Экзон – кодирующая часть ДНК.

Секвенирование – установление последовательности нуклеотидов в молекулах нуклеиновых кислот.

Теломераза – это фермент, который обеспечивает добавление недостающих теломерных повторов к концам хромосом и способствует, таким образом, восстановлению длины теломер.

Интеграза — фермент, осуществляющий внедрение какого-либо генетического элемента в геном

СФУУРММ-Формы – представления.

Фокусная Динамика – это главный механизм проявления любой из формо-структур Пространства-Времени (так называемой «геометрии пространства»); инерционное формирование (динамика) в информационном пространстве самосознания СФУУРММ-Форм (представлений) о себе и об окружающей действительности.

Тип бирвуляртности – образование узкоспецифических типов энергоинформационных взаимосвязей в определённом направлении развития.

Прото-Форма – люди, животные, растения, микроорганизмы, молекула и т.д.

ОДС – ОЛЛАКТ-ДРУОТММ-система – это ноовременная информационная «база», эфирная структура, являющаяся источником всех СФУУРММ-Форм, из которых мы специфически формируем все наши — как самые высшие, так и самые низшие — мысли и чувства, психоментальные переживания, в зависимости от того, в какой из параллельных «сценариев» будет осуществлена перефокусировка. В ОДС СФУУРММ-Формы резонационно группируются по своему субъективному смыслу в бесчисленное множество смысловых блоков информации – УУ-ВВУ-Конгломераты.

Схема Синтеза – синоним типа бирвуляртности.

Амплификация – эволюционирование.

Ссылки на первоисточники:

[1] Имеется ли в геноме «эгоистичная» ДНК? 

[2] Энцеклопедия элементов ДНК

[3] Журнал «Nucleic Acids Research». (Исследования нуклеиновых кислот). КОДИРОВАНИЯ целого генома данные в браузере генома УСК. Центр биомолекулярных наук и инженерии, Школа инженерии и Медицинского института Говарда Хьюза, Калифорнийский университет в Санта-Круз (УСК), Санта-Крус, штат Калифорния 95064, США  

[4] Тарантул Вячеслав Залманович «Геном человека: Энциклопедия, написанная четырьмя буквами»

[5] Документальный фильм "Творцы человечества (ДНК, Генная инженерия)"

[6] Орис О.В., «Основы ииссиидиологии», Том 5

[7] «Семейство повторов по имени Alu»

 

Просмотров: 1160